Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLGNO14967 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLGNO14967 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLGNO14967 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLGNO14967 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLGNO14967 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLGNO14967 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLGNO14967 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLGNO14967 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLGNO14967 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLGNO14967 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLGNO14967 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLGNO14967 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLGNO14967 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLGNO14967 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLGNO14967 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLGNO14967 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLGNO14967 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLGNO14967 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLGNO14967 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLGNO14967 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLGNO14967 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLGNO14967 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLGNO14967 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLGNO14967 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLGNO14967 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLGNO14967 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLGNO14967 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLGNO14967 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLGNO14967 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLGNO14967 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLGNO14967 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLGNO14967 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLGNO14967 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLGNO14967 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLGNO14967 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLGNO14967 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLGNO14967 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLGNO14967 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLGNO14967 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLGNO14967 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLGNO14967 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLGNO14967 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLGNO14967 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLGNO14967 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLGNO14967 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLGNO14967 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLGNO14967 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLGNO14967 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLGNO14967 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLGNO14967 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLGNO14967 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLGNO14967 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLGNO14967 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLGNO14967 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLGNO14967 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLGNO14967 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLGNO14967 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLGNO14967 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLGNO14967 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLGNO14967 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLGNO14967 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLGNO14967 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLGNO14967 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLGNO14967 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLGNO14967 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLGNO14967 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLGNO14967 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLGNO14967 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLGNO14967 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLGNO14967 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLGNO14967 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLGNO14967 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLGNO14967 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLGNO14967 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLGNO14967 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLGNO14967 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLGNO14967 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLGNO14967 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLGNO14967 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLGNO14967 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLGNO14967 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLGNO14967 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLGNO14967 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLGNO14967 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLGNO14967 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLGNO14967 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLGNO14967 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLGNO14967 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLGNO14967 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLGNO14967 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLGNO14967 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms