Protein–RNA interactions for Protein: O14556

GAPDHS, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, testis-specific, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHSO14556 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAPDHSO14556 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAPDHSO14556 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPDHSO14556 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPDHSO14556 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPDHSO14556 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPDHSO14556 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms