Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QR89 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QR89 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QR89 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QR89 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QR89 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QR89 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QR89 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QR89 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QR89 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QR89 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QR89 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QR89 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QR89 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QR89 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QR89 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QR89 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QR89 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QR89 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QR89 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QR89 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QR89 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QR89 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QR89 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QR89 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QR89 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
J3QR89 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
J3QR89 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QR89 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QR89 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QR89 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QR89 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QR89 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QR89 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QR89 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QR89 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QR89 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QR89 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QR89 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3QR89 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3QR89 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QR89 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QR89 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QR89 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QR89 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QR89 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QR89 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QR89 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QR89 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QR89 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QR89 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QR89 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QR89 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3QR89 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3QR89 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3QR89 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QR89 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QR89 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QR89 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QR89 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QR89 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QR89 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QR89 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QR89 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QR89 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QR89 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QR89 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QR89 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QR89 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QR89 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QR89 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3QR89 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3QR89 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3QR89 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3QR89 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms