Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2LH3BP13 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2LH3BP13 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2LH3BP13 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms