Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BM21 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BM21 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BM21 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BM21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BM21 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BM21 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BM21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BM21 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BM21 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BM21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BM21 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BM21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BM21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BM21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BM21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BM21 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BM21 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BM21 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BM21 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BM21 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BM21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BM21 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BM21 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BM21 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BM21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BM21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BM21 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BM21 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BM21 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BM21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BM21 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BM21 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BM21 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BM21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BM21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BM21 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BM21 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BM21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BM21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BM21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BM21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BM21 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BM21 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BM21 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BM21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BM21 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BM21 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BM21 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BM21 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BM21 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BM21 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BM21 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BM21 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BM21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BM21 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BM21 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BM21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BM21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BM21 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BM21 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BM21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BM21 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BM21 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BM21 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BM21 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BM21 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BM21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BM21 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BM21 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BM21 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BM21 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BM21 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BM21 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BM21 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BM21 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BM21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BM21 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BM21 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BM21 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BM21 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BM21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BM21 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BM21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BM21 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BM21 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BM21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BM21 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BM21 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BM21 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BM21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BM21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BM21 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BM21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BM21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BM21 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BM21 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BM21 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BM21 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BM21 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms