Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM114B3SHH9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM114B3SHH9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms