Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIGD1CA8MV81 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1CA8MV81 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1CA8MV81 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms