Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1LA8MT33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1LA8MT33 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms