Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP27XA6NNY8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP27XA6NNY8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP27XA6NNY8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms