Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NL46 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NL46 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NL46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NL46 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NL46 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NL46 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NL46 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NL46 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NL46 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NL46 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NL46 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NL46 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NL46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NL46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A6NL46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A6NL46 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NL46 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NL46 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NL46 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NL46 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NL46 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NL46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NL46 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NL46 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NL46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NL46 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NL46 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NL46 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NL46 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NL46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NL46 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NL46 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NL46 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NL46 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NL46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NL46 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NL46 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NL46 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NL46 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NL46 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NL46 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NL46 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NL46 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NL46 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NL46 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NL46 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NL46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NL46 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NL46 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NL46 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NL46 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NL46 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NL46 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NL46 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NL46 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NL46 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NL46 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NL46 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NL46 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NL46 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NL46 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NL46 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NL46 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NL46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NL46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NL46 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NL46 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NL46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NL46 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NL46 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NL46 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NL46 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms