Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf49A4QMS7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
C5orf49A4QMS7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf49A4QMS7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms