Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0B4J293 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0B4J293 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0B4J293 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J293 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J293 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J293 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J293 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J293 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J293 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J293 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J293 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J293 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J293 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J293 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J293 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J293 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J293 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J293 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J293 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J293 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J293 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J293 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J293 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J293 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J293 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J293 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J293 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J293 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J293 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J293 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J293 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J293 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J293 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
A0A0B4J293 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0B4J293 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms