Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms