Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR35Q9HC97 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms