Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTD2Q9H8S5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms