Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms