Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms