Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBP5Q96PP8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms