Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB3A2Q96PL1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms