Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms