Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms