Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms