Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM12Q96EX1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms