Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms