Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTHRC1Q96CG8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTHRC1Q96CG8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTHRC1Q96CG8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTHRC1Q96CG8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTHRC1Q96CG8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTHRC1Q96CG8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTHRC1Q96CG8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTHRC1Q96CG8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTHRC1Q96CG8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms