Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 39.6
TBRG4Q969Z0 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 39.6
TBRG4Q969Z0 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.7□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 39.6
TBRG4Q969Z0 SHANK2-213ENST00000460048 736 ntTSL 516.06■□□□□ 0.167e-7■■■■■ 39.5
TBRG4Q969Z0 CFDP1-208ENST00000569341 454 ntTSL 34.14□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 39.5
TBRG4Q969Z0 CFDP1-211ENST00000612761 395 ntTSL 32.73□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 39.5
TBRG4Q969Z0 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 39.5
TBRG4Q969Z0 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 414.87□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 39.4
TBRG4Q969Z0 LRMDA-210ENST00000593817 221 ntTSL 34.81□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 39.4
TBRG4Q969Z0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 39.4
TBRG4Q969Z0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 39.3
TBRG4Q969Z0 CCDC85C-202ENST00000554877 543 ntTSL 411.98□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CCDC85C-203ENST00000554996 619 ntTSL 410.3□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 RBM33-206ENST00000392761 2934 ntTSL 213.69□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 LRRC75B-204ENST00000460524 2276 ntTSL 528.5■■■□□ 2.152e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 LRRC75B-203ENST00000446942 1828 ntTSL 527.74■■■□□ 2.032e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 LRRC75B-202ENST00000404045 1417 ntTSL 327.62■■■□□ 2.012e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.862e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.762e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ZNF598-206ENST00000564824 2147 ntTSL 525.35■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.522e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 RERE-208ENST00000465125 396 ntTSL 524.26■■□□□ 1.474e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.392e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)23.17■■□□□ 1.34e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.98■■□□□ 1.274e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 EML3-207ENST00000460939 1770 ntTSL 522.91■■□□□ 1.269e-10■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRPSAP1-205ENST00000442767 908 ntTSL 522.58■■□□□ 1.212e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 LRRC75B-207ENST00000491910 2943 ntTSL 221.99■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOLLIP-204ENST00000527085 595 ntTSL 521.84■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-216ENST00000471948 2119 ntTSL 221.74■■□□□ 1.072e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-221ENST00000477707 581 ntTSL 420.88■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ANO7-204ENST00000451047 555 ntTSL 320.87■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 320.68■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NR4A1-219ENST00000562373 838 ntTSL 320.54■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOLLIP-206ENST00000527746 590 ntTSL 220.47■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.848e-11■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 HIF1A-206ENST00000553999 616 ntTSL 420.12■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ZNF598-207ENST00000565396 4457 ntTSL 219.92■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)19.83■□□□□ 0.774e-12■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOLLIP-210ENST00000530506 1297 ntTSL 519.72■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOLLIP-205ENST00000527638 561 ntTSL 419.72■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 HSD17B12-212ENST00000636722 540 ntTSL 419.62■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-216ENST00000454540 392 ntTSL 519.56■□□□□ 0.722e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.728e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.718e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.698e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-213ENST00000463865 1999 ntTSL 519.35■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 519.25■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRPSAP1-204ENST00000436498 1003 ntTSL 319.17■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ZNF598-203ENST00000562988 3382 ntTSL 518.99■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PTBP3-201ENST00000210227 734 ntTSL 218.81■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.588e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.588e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 OSBPL10-205ENST00000452791 485 ntTSL 318.65■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOX3-205ENST00000568436 548 ntTSL 318.56■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.558e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ANO7-208ENST00000481071 1905 ntTSL 518.4■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TDG-208ENST00000544060 1139 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 318.14■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ATP2B2-209ENST00000480680 1739 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ANO7-205ENST00000459928 2139 ntTSL 1 (best)17.72■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 EPHA2-204ENST00000480202 795 ntTSL 517.64■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.48e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 317.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.388e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C19orf25-212ENST00000592605 357 ntTSL 317.4■□□□□ 0.388e-16■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TBCD-204ENST00000571316 1509 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.379e-10■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 MYO1E-204ENST00000558646 578 ntTSL 217.32■□□□□ 0.364e-12■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ABHD14B-207ENST00000487005 1998 ntTSL 217.1■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 317.02■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SYS1-DBNDD2-203ENST00000458187 673 ntAPPRIS P5 TSL 516.91■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 39.2
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 238.5 ms