Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF1Q8N6C5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF1Q8N6C5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF1Q8N6C5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF1Q8N6C5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF1Q8N6C5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms