Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms