Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms