Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms