Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms