Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms