Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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CNGA3Q16281 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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CNGA3Q16281 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CNGA3Q16281 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CNGA3Q16281 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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