Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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