Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms