Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PEX6Q13608 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PEX6Q13608 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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