Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms