Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms