Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms