Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms