Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms