Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP98P52948 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP98P52948 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP98P52948 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP98P52948 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP98P52948 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP98P52948 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP98P52948 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP98P52948 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms