Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV1P50549 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms