Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms