Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD52P43351 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD52P43351 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD52P43351 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD52P43351 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD52P43351 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms