Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MLH1P40692 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MLH1P40692 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MLH1P40692 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MLH1P40692 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MLH1P40692 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MLH1P40692 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MLH1P40692 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MLH1P40692 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms