Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms