Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms