Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LAP3P28838 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAP3P28838 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAP3P28838 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms