Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTX3P26022 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTX3P26022 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTX3P26022 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms